Aus diesem Grund beschränken wir uns ja auch auf dem Mars/Mond auf die Suche nach Wasser, es gibt Lebensformen die ohne auskommen, aber man hält es für einfacher(?) nur nach auf Wasser angewiesenen Lebensformen zu suchen. Genauso läufts auch beim kontaktieren. Wir reden nur mit denen, die grade zufällig auf unserer Frequenz zuhören...
Das tun wir unter anderem auch deswegen, weil unser Stand der Technik selbst Einschränkungen unterliegt.
Den Milimeterwellenbereich im Bereich von 30-300 GHz erschließen wir z.B. erst nach und nach. Vor ein paar Jahren wäre dieser Bereich für uns technisch nicht realisierbar gewesen.
Transistoren die mit >= 30 GHz schalten, um eine digitale Kommunikation in diesem Bereich überhaupt zu erlauben, gibt es bspw. ebenfalls erst seit einigen Jahren.
Auch gibt es Unterschiede in der Sensortechnik. Lichtsensoren für Licht, welches zwischen 385–750 THz arbeitet stand uns z.B. wesentlich früher zur Verfügung, als eben Sensoren für die oberen Funkbereiche zwischen z.B. 30-300 GHz.
Bezüglich der Frage, womit Außerirdische gegenseitig kommunizieren, sofern sie es gibt und sie technisch dazu in der Lage sind und die Technik auch schon eine Weile bei denen entwickelt ist, würde ich davon ausgehen, dass sie in einem sehr hohen Frequenzbereich kommunizieren, denn umso höher der Frequenzbereich, desto mehr Daten kann man darin unterbringen.
Laser wäre also ein geeigneter Kandidat. Ebenso alle Frequenzbereiche oberhalb von 30 GHz.
Wie man sieht, wir kommunizieren in diesem Bereich noch kaum.
Zusätzlich wäre hier aber noch zu betrachten, welche Freuquenzbereiche vom Weltall besonders gut geschluckt oder gestört werden, diese würde man logischerweise vermeiden.
Die Frage nach "Atmosphäre überbrücken" stellt sich nicht, denn eine Raumfahrende Zivilisation würde hierfür selbstverständlich Relaysatelliten verwenden
um sowohl für die Übertragung durch den Weltall als auch durch eine Atmosphäre hindurch jeweils verschiedene und die am besten geeigneten Verfahren verwenden. D.h. für die Kommunikation durch den Wellall würde die eine anderen Frequenzbereich als durch die Atmosphäre verwenden, denn beide Räume haben unterschiedliche Dämpfungs- und Störeigenschaften. Bei Laser stören z.B. die Wolken in der Atmosphäre, trotzdem wäre Laser im Weltraum super, weil man eben mehr Daten unterbringen kann. Die Frage wäre dann nur noch, inwiefern die paar Wasserstoffatome und sonstige Teilchen im Kubikmeter Vakuum des Weltraums stören.
Und zum Schluss sei noch gesagt, das diese Hochfrequenten Frequenzen die Eigenschaft mit sich bringen, dass sie in der Regel auf einer Richtfunktechnik basieren, d.h. selbst wenn die Aliens mit Laser kommunizieren, hätten wir nur schlechte Chancen sie abzuhören, wenn wir selbst nicht im Bereich es Lasers liegen.