Natürlich wird er steigen!
Was den Balon steigen lässt ist der Untereschied in der potentiellen Energie des Systems. Der schwerere Luft über dem Ballon *will* ja nach unten. Jedes System, wenn es sich selbst überlassen bleibt nimmt ein energetisch günstigen Zustand ein. So auch hier: es ist energetisch günstiger, wenn ein Ballon (wenn auch mit Vakuum, mit der Hypotetischen supper starken, aber ultra leichten Hülle) oben schwebt, als es unten steht.
Grob Betrachtet, sich dir das Ganze als ein System aus zwei Ballonen: einer befinde sich oben mit Luft gefüllt, anderer evakuiert unten. Die beiden sind auf einem Stab fest verbunden. Um das Ganze Herum ist ein Vakuum, Luft, Wasser, ist völlig egal, hauptsache es hersche die schwerkraft. Da die Masse des oberen Ballons größer ist, als die des unteren, ist das gleichgewicht nicht stabil. und bei der geringsten Störung kippt der Stab.